Η Κλινική αρχικά δέχτηκε ιατρούς για μερική ειδίκευση στην Παιδιατρική. Τον Ιούλιο του 2003 (ΦΕΚ 1050/29-7-2003), όταν είχε αρχίσει να αυξάνεται ο αριθμός και η βαρύτητα των νοσηλευομένων περιστατικών, εγκρίθηκε η δυνατότητα να παρέχει πλήρη ειδικότητα Παιδιατρικής. Έκτοτε, η Πανεπιστημιακή Παιδιατρική Κλινική αποτελεί τη μοναδική Κλινική στην 5η ΥΠΕ, η οποία παρέχει πλήρη ειδίκευση στην Παιδιατρική.

Εκπαίδευση Ειδικευόμενων Ιατρών (10 οργανικές θέσεις)

Οι ειδικευόμενοι γιατροί συμμετέχουν στη φροντίδα των νοσηλευομένων όσο και των εξωτερικών ασθενών (Τακτικών και Ειδικών Εξωτερικών Ιατρείων και Τμήματος Επειγόντων Περιστατικών), υπό την καθοδήγηση των Επιμελητών ΕΣΥ και των μελών ΔΕΠ. Παρακολουθούν επίσης και συμμετέχουν, εκ περιτροπής και βάσει προγράμματος, στην παρουσίαση ενδιαφερουσών περιπτώσεων, στις βιβλιογραφικές ενημερώσεις και στις κλινικοακτινολογικές συναντήσεις (με το Εργαστήριο Ακτινολογίας-Ιατρικής Απεικόνισης).

Κάθε ειδικευόμενος γιατρός έχει στην ευθύνη του νοσηλευόμενους ασθενείς και αναφέρεται σε συγκεκριμένους Επιμελητές και μέλη ΔΕΠ της Κλινικής. Συμμετέχει επίσης εκ περιτροπής στη λειτουργία όλων των Ειδικών και Τακτικών Ιατρείων της Κλινικής (ανά δίμηνο σε κάθε Ιατρείο), καθώς και στο πρόγραμμα εφημεριών της Κλινικής.

Κατά τη διάρκεια της ειδίκευσής τους στην Παιδιατρική, οι ειδικευόμενοι γιατροί της Κλινικής εκπαιδεύονται επί εξάμηνο στη Νεογνολογία στη Μονάδα Εντατικής Νοσηλείας Νεογνών, στην Αίθουσα του Μαιευτηρίου και στα φυσιολογικά νεογνά που είναι παρά την κλίνη των μητέρων τους στην Μαιευτική Κλινική.

Κατά τακτά χρονικά διαστήματα εξετάζονται σε καθορισμένη ύλη της Παιδιατρικής με γραπτές εξετάσεις – τεστ πολλαπλής επιλογής

Εκπαιδευτικό πρόγραμμα Κλινικής 

Το εκπαιδευτικό πρόγραμμα αναρτάται κάθε μήνα και λαμβάνει χώρα η υλοποίηση του στην Αίθουσα Σεμιναρίων της Κλινικής. Συμμετέχουν οι φοιτητές του ΣΤ΄ έτους, οι ειδικευόμενοι και οι ειδικευμένοι γιατροί της Κλινικής.

• Κάθε Τετάρτη γίνονται εισηγήσεις μαθήματα από τους ειδικευμένους ιατρούς στους ειδικευόμενους.
• Κάθε Πέμπτη γίνεται βιβλιογραφική ενημέρωση από ειδικευμένο ιατρό της Κλινικής. Παρουσιάζονται τα νεότερα δεδομένα από τη διεθνή βιβλιογραφία που αφορούν σε τρέχοντα θέματα της Παιδιατρικής.
• Κάθε Παρασκευή ένας ειδικευόμενος ιατρός, υπό την καθοδήγηση ειδικευμένου ιατρού, παρουσιάζει ένα ενδιαφέρον περιστατικό με ανασκόπηση της τρέχουσας βιβλιογραφίας.
• Μία φορά μηνιαίως (την 2η Τρίτη) γίνεται Κλινικο-ακτινολογική συνάντηση σε συνεργασία με το Εργαστήριο Ακτινολογίας - Ιατρικής Απεικόνισης του Πανεπιστημιακού Νοσοκομείου Λάρισας. Συζητούνται ακτινογραφίες, αξονικές και μαγνητικές τομογραφίες παιδιών που νοσηλεύτηκαν στην Παιδιατρική Κλινική